Programvara för mikrobiologi

Förutom mikroskop och petriskålar, datorer är ett viktigt verktyg för mikrobiologer. Programvara för mikrobiologisk forskning inkluderar verktyg som används av andra vetenskapliga och tekniska discipliner samt specialiserade applikationer för studier av bakterier och andra mikroorganismer. Många applikationer utvecklade av statliga myndigheter, ideella stiftelser eller akademiska forskare finns som gratis programvara att ladda ner och använda som ditt experiment eller laboratorium kräver.

Visualiseringsverktyg

En fysisk eller mental bild av rådata som du samlar in kan hjälpa dig att bättre förstå dess kvalitet, betydelse och konsekvenser. Öppen källkod och kommersiell datavisualiseringsprogramvara är allmänt tillgänglig för mikrobiologisk forskning. Skapa diagram och diagram över dina data med LibreOffice Calc, Microsofts Excel eller Mondrian datavisualiseringssystem. Cell-O- och RasMol-applikationer hjälper dig att skapa 2D- och 3D-animerade modeller av biologiskt signifikanta molekyler som proteiner och aminosyror.

Matematisk modellering

Stora samlingar av mikrobiologidata ger ofta mer meningsfull information när de har analyserats numeriskt. MATLAB, Octave och SciPy mjukvarupaket som utför matematisk förfining, analys och modellering av forskares data. Använd dessa paket för att göra parameteruppskattning genom kurvpassning, epidemiologiska förutsägelser, bakterietillväxtsimuleringar och dataljud eller eliminering av stokastisk effekt. Denna applikation utför också statistiska beräkningar, som variansanalyser eller Chi-square-tester.

Genome Bioinformatics

Program för mikrobiologi hjälper dig också att visualisera och utvinna information från sekvensen av nukleinsyror som utgör en mikroorganisms DNA. Open Bioinformatics Foundation erbjuder gratis, open-source DNA-sekvensering och analysapplikationer som BioJava och Biopython som extraherar data från genominformationsbanker, analysera en organisms DNA -kod och jämföra den med andra DNA -prover. Ytterligare genomanalyspaket inkluderar Emboss, HMMER, Clustal Omega, Phylogeny Inference Package, eller PHYLIP, och Sequence Manipulation Suite, eller sms.

Referensprogramvara

Den snabba vetenskapliga upptäckten inom mikrobiologi och förändrade myndighetsbestämmelser gör det viktigt att mikrobiologer har snabb tillgång till den information som påverkar deras arbete. HUGO är ett kommersiellt mjukvarupaket som ger mikrobiologer aktuell information om verktyg, kemikalier, Utrustning, kulturmedia, säkerhetskrav, nya organismer, taxonomiska förändringar och antibiotika. Dessutom, mikrobiologer som arbetar inom livsmedelsvetenskap kan använda webbprogrammet ComBase Browser för att komma åt de livsmedelsrelaterade mikrobiologiska data som tillhandahålls av myndigheter i Storbritannien, Australien och USA.